Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAN3Q58A45 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAN3Q58A45 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms