Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms