Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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