Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms