Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP20-1Q3LI63 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms