Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL24A1Q17RW2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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