Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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