Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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