Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NDUFA9Q16795 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NDUFA9Q16795 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NDUFA9Q16795 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NDUFA9Q16795 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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