Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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FOXD1Q16676 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
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FOXD1Q16676 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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