Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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ECM1Q16610 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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ECM1Q16610 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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