Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PCSK7Q16549 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCSK7Q16549 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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