Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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