Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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