Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SF1Q15637 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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