Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms