Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX1-1Q15270 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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