Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRRQ15256 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRRQ15256 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRRQ15256 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRRQ15256 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRRQ15256 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRRQ15256 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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