Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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