Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD3Q15054 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms