Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM25Q14258 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms