Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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