Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms