Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms