Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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