Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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