Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGB3BPQ13352 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGB3BPQ13352 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGB3BPQ13352 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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