Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTK7Q13308 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTK7Q13308 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTK7Q13308 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTK7Q13308 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTK7Q13308 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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PTK7Q13308 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTK7Q13308 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTK7Q13308 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTK7Q13308 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTK7Q13308 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTK7Q13308 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTK7Q13308 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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