Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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