Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms