Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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