Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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