Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
STX4Q12846 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STX4Q12846 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STX4Q12846 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms