Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SREBF2Q12772 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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