Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD47Q08722 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms