Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PUDPQ08623 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms