Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNDQ07001 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms