Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1T1Q06455 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms