Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms