Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms