Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC4Q03721 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms