Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms