Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms