Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4GALNT1Q00973 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms