Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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