Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms