Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX6P78412 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX6P78412 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX6P78412 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX6P78412 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.6 ms