Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms