Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms