Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VBP1P61758 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms